Музей прикладного искусства был открыт в 1987 г. в отреставрированном здании Старого арсенала (XVI в.) Нижнего замка.
В середине XVI в. вильнюсский арсенал был одним из крупнейших в Речи Посполитой. Ранее на месте арсенала были деревянные здания, мостовая и оборонительная стена Нижнего замка XII–XIV вв. Фрагменты сохранившихся более ранних культурных слоев Вильнюса выставляются в подвалах Арсенала.
Арсенал был восстановлен и приспособлен под музей по проекту архитектора Эвалдаса Пурлиса. При восстановлении и перестройке под музей Арсенала восстановлена позднеготическая структура пространства и план XVI в., ренессансные фасады начала XVII в.
В музее можно увидеть литовские и зарубежные произведения прикладного и визуального искусства с XIV в. Возраст выставляемых археологических находок датируется III тысячелетием до нашей эры.
