Городок упоминается в письменных источниках с XV в. в связи с визитом князя Ягайло. В XVI в. здесь основано поместье. В 1915 г. Бездонис получает статус городка.
В 1943 г. в лесах Бездониса был основан концентрационный лагерь, в котором погибло около 25 тыс. советских воинов и 300 евреев.
В городке есть костел, 2 школы, железнодорожная станция.
